Правильно говорить приехал из Сибири.
Определимся когда употреблять предлоги «С» и «ИЗ».
Оба предлога пространственные.
Предлог «С» употребляют для обозначения направления сверху вниз, спрыгнул с платформы, соскочил с трамвайной подножки.
Предлог «ИЗ» задает пространственное направление, откуда, выехал из гаража, из ангара.