Почему "что-то" пишется через"-"?

Потому что это дефис -то

Дефисом называют черточку, которая ставится между двумя частями слова. Через дефис пишутся следующие частицы: -то, -либо, -нибудь, -ка, -тка, -с, -де, кое- (кой-), -таки – с глаголами, наречиями и со словами всё-таки, так-таки: Ну-ка, кто-нибудь! Дай-ка книгу-то! кое-где, кой-кого, успел-таки, окончательно-таки. После других частей речи таки пишется раздельно: Я таки полагаю.

Неотрицательные частицы

В русском языке существует такая часть речи, как частицы.

Частицы - служебная часть речи, которая вносит различные оттенки значения, эмоциональные оттенки в предложении или служит для образования форм слова.

Эта часть речи не изменяется, частицы не несут лексического значения и никакими частями речи не являются.

Существуют такие частицы, которые употребляются вместе с неопределенным местоимениями и наречиями, такие частицы пишутся через дефис.

• К таким частицам относятся:  -ТО, -НИБУДЬ, -ЛИБО, КОЕ- (КОЙ-). Например: КТО-ТО, ЧТО-ЛИБО, ЧЬЯ-НИБУДЬ, КОЕ-КАКИЕ, ГДЕ-ТО, КАК-НИБУДЬ, КАК-ТО, КОЕ-ГДЕ.
• Кроме того, частица -ТО может употреблять с другими частями речи.
• Существует ещё несколько частиц, которые пишутся с дефисом, к ним относятся, но употребляются они реже: -ТКА, -КА, -ДЕ (употребляется в значении глагола "говорить"), например: УКАЖИТЕ-КА, ЧТО-ДЕ, НУ-ТКА, СМОТРИ-ТКА.

Несколько примечаний

1. Если частицы -КОЙ, -КОЕ отделяются от слова, с которым они употребляются, предлогом, то все три слова пишутся отдельно, например: КОЕ С ЧЕМ, КОЙ ДЛЯ КОГО.
2. Частица ТАКИ тоже иногда пишется через дефис, это происходит тогда, когда употребляется после глаголов (УВИДЕЛ-ТАКИ), наречий (ВСЁ-ТАКИ), а также после других частей речи, но в оставшихся случаях эта частица пишется отдельно, например: ОН ТАКИ ВЫИГРАЛ В ЛОТЕРЕЮ.
3. Частицы, которые пишутся через дефис, тоже могут писаться отдельно, это происходит тогда, когда после частицы стоит ещё одна частица, например: КОМУ ЖЕ НИБУДЬ Я ДОЛЖНА ЭТО СКАЗАТЬ; ВСЁ Ж ТАКИ, ОН БЫ ДЕ ЭТОГО НЕ СКАЗАЛ.
4. Раздельно пишется сочетание как то ('а именно') перед перечислением однородных членов, например: В лесах встречаются разные деревья, как то: осина,береза, кедр, сосна.
5. Если частицы -ТО, -ТАКИ, -ДЕ входят в состав сложного слова, части которого соединены дефисом, то дефис пишется только перед частицей, а после нее опускается, например: ПОДОБРУ-ТО ПОЗДОРОВУ, ПОСТОЯЛ-ТАКИ ПОСТОЯЛ И УШЕЛ.

Ответ: "что-то" пишется через дефис, потому что есть частица -то.