Причина исчезновения венериной башмачка связана с ее медленным размножением. Процесс от прорастания семени до появления цветков занимает 15-20 лет, что делает вид уязвимым перед утратой естественной среды, вырубкой лесов и незаконным сбором.
Сбор на букеты. Срывая стебель с цветками, люди обрекают корневище на голодную смерть — ведь именно листья обеспечивают его питанием. Вырубка лесов. Уничтожение среды обитания растения приводит к его исчезновению. Кислотные дожди. Они угнетают симбиотические грибы, которые необходимы для прорастания семян венерина башмачка. Осушение территорий, где растёт растение. Это наносит ущерб популяции, так как башмачок предпочитает болотистые сырые места. Неконтролируемый выпас скота. Животные съедают растение, а также вытаптывают место, где оно росло.